Ústav se podílí na výuce několika předmětů v rámci oboru Všeobecné lékařství, a to jak v českém, tak v anglickém jazyce. Konkrétně se jedná o výuku histologie a embryologie v rámci předmětu Anatomie, histologie a embryologie a morfologických aspektů cytologie v rámci předmětu Buňka.
Ústav dále nabízí postgraduální doktorské studium biomedicíny v oborech Biologie a patologie buňky a Fyziologie a patofyziologie člověka.
Spolupracujeme také s Fakultou biomedicínského inženýrství ČVUT, pro kterou zajišťujeme výuku předmětu Histologie obecná a histologie oka.